Protein–RNA interactions for Protein: P11274

BCR, Breakpoint cluster region protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCRP11274 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCRP11274 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCRP11274 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCRP11274 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCRP11274 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BCRP11274 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCRP11274 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCRP11274 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCRP11274 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCRP11274 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCRP11274 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCRP11274 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCRP11274 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BCRP11274 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCRP11274 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCRP11274 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCRP11274 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCRP11274 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCRP11274 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCRP11274 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCRP11274 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCRP11274 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCRP11274 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCRP11274 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCRP11274 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCRP11274 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCRP11274 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCRP11274 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCRP11274 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCRP11274 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCRP11274 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCRP11274 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCRP11274 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCRP11274 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCRP11274 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCRP11274 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BCRP11274 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BCRP11274 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BCRP11274 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BCRP11274 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BCRP11274 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BCRP11274 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BCRP11274 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCRP11274 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCRP11274 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCRP11274 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BCRP11274 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCRP11274 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCRP11274 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCRP11274 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCRP11274 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCRP11274 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCRP11274 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCRP11274 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCRP11274 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BCRP11274 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCRP11274 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCRP11274 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCRP11274 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCRP11274 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCRP11274 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCRP11274 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCRP11274 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCRP11274 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCRP11274 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCRP11274 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCRP11274 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCRP11274 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCRP11274 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCRP11274 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BCRP11274 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCRP11274 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCRP11274 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCRP11274 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCRP11274 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BCRP11274 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCRP11274 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCRP11274 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCRP11274 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BCRP11274 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCRP11274 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCRP11274 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCRP11274 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BCRP11274 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCRP11274 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCRP11274 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCRP11274 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCRP11274 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BCRP11274 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCRP11274 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCRP11274 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCRP11274 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BCRP11274 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCRP11274 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BCRP11274 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCRP11274 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCRP11274 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCRP11274 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCRP11274 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCRP11274 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms