Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNTO95613 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNTO95613 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNTO95613 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNTO95613 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNTO95613 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNTO95613 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNTO95613 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNTO95613 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNTO95613 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNTO95613 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNTO95613 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNTO95613 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNTO95613 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNTO95613 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNTO95613 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNTO95613 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNTO95613 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNTO95613 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNTO95613 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNTO95613 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNTO95613 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNTO95613 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNTO95613 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNTO95613 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNTO95613 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNTO95613 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNTO95613 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNTO95613 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNTO95613 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNTO95613 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNTO95613 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNTO95613 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNTO95613 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNTO95613 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNTO95613 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNTO95613 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNTO95613 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNTO95613 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNTO95613 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNTO95613 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNTO95613 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNTO95613 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNTO95613 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNTO95613 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNTO95613 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNTO95613 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNTO95613 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNTO95613 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNTO95613 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNTO95613 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNTO95613 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNTO95613 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNTO95613 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNTO95613 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNTO95613 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNTO95613 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNTO95613 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNTO95613 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNTO95613 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNTO95613 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNTO95613 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNTO95613 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNTO95613 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNTO95613 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNTO95613 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNTO95613 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNTO95613 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNTO95613 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNTO95613 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNTO95613 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNTO95613 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNTO95613 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNTO95613 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNTO95613 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNTO95613 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNTO95613 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNTO95613 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNTO95613 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNTO95613 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNTO95613 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNTO95613 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNTO95613 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNTO95613 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNTO95613 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNTO95613 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNTO95613 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNTO95613 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNTO95613 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNTO95613 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNTO95613 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNTO95613 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNTO95613 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNTO95613 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNTO95613 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNTO95613 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNTO95613 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNTO95613 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNTO95613 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNTO95613 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms