Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM2O94769 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM2O94769 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM2O94769 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM2O94769 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM2O94769 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM2O94769 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM2O94769 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM2O94769 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM2O94769 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM2O94769 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM2O94769 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM2O94769 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM2O94769 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM2O94769 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM2O94769 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM2O94769 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM2O94769 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM2O94769 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM2O94769 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM2O94769 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM2O94769 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM2O94769 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM2O94769 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM2O94769 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM2O94769 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM2O94769 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM2O94769 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM2O94769 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM2O94769 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM2O94769 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM2O94769 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM2O94769 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM2O94769 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM2O94769 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM2O94769 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM2O94769 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ECM2O94769 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM2O94769 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM2O94769 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM2O94769 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM2O94769 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM2O94769 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM2O94769 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM2O94769 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM2O94769 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM2O94769 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM2O94769 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM2O94769 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM2O94769 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM2O94769 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM2O94769 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM2O94769 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM2O94769 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM2O94769 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM2O94769 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM2O94769 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM2O94769 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM2O94769 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM2O94769 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM2O94769 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM2O94769 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM2O94769 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM2O94769 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM2O94769 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM2O94769 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM2O94769 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM2O94769 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM2O94769 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM2O94769 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM2O94769 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM2O94769 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM2O94769 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM2O94769 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM2O94769 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM2O94769 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM2O94769 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM2O94769 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM2O94769 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM2O94769 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM2O94769 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM2O94769 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM2O94769 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM2O94769 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM2O94769 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM2O94769 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM2O94769 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM2O94769 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM2O94769 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms