Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
KIAA0556O60303 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms