Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms