Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLXNB1O43157 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms