Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms