Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD42Q8N9B4 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD42Q8N9B4 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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