Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTF1AQ7RTS3 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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