Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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PDCD1Q15116 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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