Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms