Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms