Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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