Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms