Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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TCIRG1Q13488 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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TCIRG1Q13488 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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TCIRG1Q13488 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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TCIRG1Q13488 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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TCIRG1Q13488 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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TCIRG1Q13488 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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TCIRG1Q13488 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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TCIRG1Q13488 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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