Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
DUSP4Q13115 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
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