Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms