Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms