Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms