Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
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PGGT1BP53609 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
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PGGT1BP53609 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
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PGGT1BP53609 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
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PGGT1BP53609 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
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PGGT1BP53609 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
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PGGT1BP53609 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
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PGGT1BP53609 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
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PGGT1BP53609 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
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