Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTPAP49638 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TTPAP49638 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
TTPAP49638 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TTPAP49638 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TTPAP49638 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TTPAP49638 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TTPAP49638 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TTPAP49638 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TTPAP49638 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TTPAP49638 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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