Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRDP23468 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms