Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
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ERVV-1B6SEH8 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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ERVV-1B6SEH8 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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ERVV-1B6SEH8 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
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ERVV-1B6SEH8 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ERVV-1B6SEH8 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
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