Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms