Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP35Q9P2H5 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms