Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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