Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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SEC23BQ15437 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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SEC23BQ15437 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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SEC23BQ15437 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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SEC23BQ15437 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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SEC23BQ15437 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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