Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms