Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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CHD4Q14839 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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CHD4Q14839 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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CHD4Q14839 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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CHD4Q14839 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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CHD4Q14839 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
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CHD4Q14839 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
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CHD4Q14839 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
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CHD4Q14839 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
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