Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
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