Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms