Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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PGGT1BP53609 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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PGGT1BP53609 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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PGGT1BP53609 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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