Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SMG9Q9H0W8 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms