Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TM6SF1Q9BZW5 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TM6SF1Q9BZW5 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TM6SF1Q9BZW5 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TM6SF1Q9BZW5 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TM6SF1Q9BZW5 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TM6SF1Q9BZW5 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TM6SF1Q9BZW5 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TM6SF1Q9BZW5 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TM6SF1Q9BZW5 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TM6SF1Q9BZW5 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TM6SF1Q9BZW5 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TM6SF1Q9BZW5 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TM6SF1Q9BZW5 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TM6SF1Q9BZW5 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TM6SF1Q9BZW5 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms