Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms