Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
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