Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 VPS13A-203ENST00000360280 15320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 USF3-201ENST00000316407 13708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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HERC1Q15751 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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HERC1Q15751 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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