Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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CHD4Q14839 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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CHD4Q14839 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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CHD4Q14839 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
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CHD4Q14839 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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CHD4Q14839 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHD4Q14839 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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