Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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ITGA9Q13797 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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ITGA9Q13797 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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ITGA9Q13797 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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ITGA9Q13797 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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ITGA9Q13797 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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ITGA9Q13797 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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ITGA9Q13797 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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ITGA9Q13797 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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ITGA9Q13797 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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ITGA9Q13797 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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ITGA9Q13797 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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