Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ALCAMQ13740 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms