Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ANK3Q12955 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.1 ms