Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.4 ms