Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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CENPFP49454 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CENPFP49454 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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CENPFP49454 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
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CENPFP49454 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CENPFP49454 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CENPFP49454 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CENPFP49454 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CENPFP49454 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CENPFP49454 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CENPFP49454 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CENPFP49454 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CENPFP49454 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CENPFP49454 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CENPFP49454 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CENPFP49454 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CENPFP49454 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CENPFP49454 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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CENPFP49454 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CENPFP49454 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CENPFP49454 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CENPFP49454 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CENPFP49454 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CENPFP49454 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CENPFP49454 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CENPFP49454 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CENPFP49454 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CENPFP49454 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CENPFP49454 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CENPFP49454 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CENPFP49454 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CENPFP49454 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CENPFP49454 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CENPFP49454 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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CENPFP49454 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CENPFP49454 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CENPFP49454 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CENPFP49454 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CENPFP49454 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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CENPFP49454 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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CENPFP49454 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
CENPFP49454 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
CENPFP49454 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
CENPFP49454 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
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