Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPREP23469 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPREP23469 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPREP23469 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPREP23469 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPREP23469 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPREP23469 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPREP23469 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPREP23469 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPREP23469 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPREP23469 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
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