Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms