Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SHOC2Q9UQ13 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms