Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CIPCQ9C0C6 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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