Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC087863.1-201ENST00000544515 570 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 FAM30C-201ENST00000561158 410 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 ZNF397-211ENST00000592264 1104 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.110-201ENST00000611670 282 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC011840.6-201ENST00000624536 610 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL139220.2-209ENST00000626342 826 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 CPSF7-226ENST00000626926 306 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 ZNF132-203ENST00000639285 1200 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 IGHV4-34-201ENST00000390616 400 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL031864.1-201ENST00000392075 423 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP119-201ENST00000410753 273 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RPL12P10-201ENST00000413498 498 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC011753.4-201ENST00000417974 311 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 FTOP1-201ENST00000419363 861 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC092569.1-201ENST00000455192 258 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC080129.1-201ENST00000457815 406 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RN7SL563P-201ENST00000481233 298 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AP003721.1-201ENST00000543907 864 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 OR7A18P-201ENST00000600416 277 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL117372.1-201ENST00000613711 459 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SMIM2-202ENST00000617002 255 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC012560.1-201ENST00000634930 459 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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