Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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CCDC142Q17RM4 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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CCDC142Q17RM4 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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CCDC142Q17RM4 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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CCDC142Q17RM4 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
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CCDC142Q17RM4 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
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CCDC142Q17RM4 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
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CCDC142Q17RM4 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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CCDC142Q17RM4 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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CCDC142Q17RM4 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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