Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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FAM187BQ17R55 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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FAM187BQ17R55 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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FAM187BQ17R55 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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FAM187BQ17R55 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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